Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pknox2Q8BG99 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pknox2Q8BG99 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms