Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms