Protein–RNA interactions for Protein: Q80YV3

Trrap, Transformation/transcription domain-associated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrrapQ80YV3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrrapQ80YV3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms