Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp8Q80YR6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8Q80YR6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8Q80YR6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms