Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk9Q80W65 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcsk9Q80W65 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms