Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms