Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otop3Q80UF9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms