Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Avl9Q80U56 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms