Protein–RNA interactions for Protein: Q80U30

Clec16a, Protein CLEC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec16aQ80U30 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clec16aQ80U30 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec16aQ80U30 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms