Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
NischQ80TM9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
NischQ80TM9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
NischQ80TM9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms