Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms