Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg1cQ7TSF0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms