Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Nphp3Q7TNH6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms