Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpf1Q7TND5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpf1Q7TND5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpf1Q7TND5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpf1Q7TND5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpf1Q7TND5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpf1Q7TND5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpf1Q7TND5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpf1Q7TND5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpf1Q7TND5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpf1Q7TND5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf1Q7TND5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms