Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms