Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg4Q7TMD7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg4Q7TMD7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms