Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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