Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms