Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms