Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms