Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms