Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Topbp1Q6ZQF0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms