Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Usp34Q6ZQ93 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Usp34Q6ZQ93 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Usp34Q6ZQ93 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Usp34Q6ZQ93 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Usp34Q6ZQ93 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Usp34Q6ZQ93 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Usp34Q6ZQ93 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Usp34Q6ZQ93 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Usp34Q6ZQ93 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms