Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chsy1Q6ZQ11 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chsy1Q6ZQ11 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
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