Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Zc3h4Q6ZPZ3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms