Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm3bQ6ZPY7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm3bQ6ZPY7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm3bQ6ZPY7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm3bQ6ZPY7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm3bQ6ZPY7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm3bQ6ZPY7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm3bQ6ZPY7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm3bQ6ZPY7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm3bQ6ZPY7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm3bQ6ZPY7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm3bQ6ZPY7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm3bQ6ZPY7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm3bQ6ZPY7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm3bQ6ZPY7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm3bQ6ZPY7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm3bQ6ZPY7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms