Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms