Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ift172Q6VH22 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ift172Q6VH22 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ift172Q6VH22 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ift172Q6VH22 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ift172Q6VH22 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ift172Q6VH22 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ift172Q6VH22 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ift172Q6VH22 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms