Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9c1Q6UJY2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms