Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms