Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms