Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b4Q6Q477 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2b4Q6Q477 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms