Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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