Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.64
Chd4Q6PDQ2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd4Q6PDQ2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms