Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q6PD19 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q6PD19 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q6PD19 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6PD19 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6PD19 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6PD19 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6PD19 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6PD19 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6PD19 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6PD19 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6PD19 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6PD19 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6PD19 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6PD19 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6PD19 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6PD19 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6PD19 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6PD19 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6PD19 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6PD19 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6PD19 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6PD19 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6PD19 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6PD19 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6PD19 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6PD19 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6PD19 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6PD19 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6PD19 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6PD19 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6PD19 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PD19 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PD19 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PD19 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PD19 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PD19 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PD19 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PD19 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PD19 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PD19 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PD19 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PD19 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PD19 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PD19 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PD19 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PD19 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PD19 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PD19 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PD19 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PD19 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PD19 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PD19 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6PD19 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6PD19 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6PD19 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6PD19 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6PD19 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6PD19 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6PD19 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6PD19 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6PD19 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6PD19 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6PD19 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6PD19 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6PD19 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6PD19 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6PD19 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6PD19 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6PD19 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6PD19 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6PD19 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6PD19 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6PD19 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6PD19 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6PD19 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6PD19 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6PD19 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6PD19 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6PD19 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6PD19 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6PD19 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6PD19 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6PD19 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6PD19 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6PD19 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6PD19 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6PD19 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6PD19 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6PD19 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6PD19 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6PD19 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6PD19 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6PD19 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6PD19 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6PD19 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6PD19 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6PD19 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6PD19 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6PD19 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms