Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slf2Q6P9P0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slf2Q6P9P0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms