Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms