Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NesQ6P5H2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms