Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4U0

Thsd7b, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7bQ6P4U0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thsd7bQ6P4U0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thsd7bQ6P4U0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Thsd7bQ6P4U0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Thsd7bQ6P4U0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thsd7bQ6P4U0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms