Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg2aQ6P4T0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg2aQ6P4T0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms