Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm2bQ6P1G2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Kdm2bQ6P1G2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm2bQ6P1G2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms