Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc189Q6NZQ0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc189Q6NZQ0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms