Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpbp1l1Q6NZP2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpbp1l1Q6NZP2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpbp1l1Q6NZP2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpbp1l1Q6NZP2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpbp1l1Q6NZP2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms