Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rprd2Q6NXI6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms