Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Frem2Q6NVD0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Frem2Q6NVD0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Frem2Q6NVD0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Frem2Q6NVD0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frem2Q6NVD0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frem2Q6NVD0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Frem2Q6NVD0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frem2Q6NVD0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frem2Q6NVD0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frem2Q6NVD0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frem2Q6NVD0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frem2Q6NVD0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms