Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SphkapQ6NSW3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SphkapQ6NSW3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms