Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt77Q6IFZ6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt77Q6IFZ6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.9 ms