Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
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