Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hecw2Q6I6G8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms