Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edrf1Q6GQV7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 509.3 ms